Marián Duffek ukončil štúdium na Lekárskej fakulte Univerzity P.J.Štefánika v Košiciach, odbor všeobecné lekárstvo. Atestáciu z chirurgie 1. stupňa získal ma Slovenskej akadémii postgraduálnej medicíny a v roku 2007 získal aj atestáciu z gastroenterologickej chirurgie na Slovenskej zdravotníckej univerzite. Od roku 1997 pôsobí na chirurgii Ústrednej vojenskej nemocnici v Ružomberku, v súčasnosti ako primár centrálnych operačných sál.

Prednosta Urologickej kliniky SZU FNsP FD Roosevelta Banská Bystrica, hlavný odborník MZ SR pre urológiu. Dlhé roky pracoval vo vedení FNsP FD Roosevelta Banská Bystrica  (námestník pre LPS, riaditeľ). Hlavným centrom záujmu sú inovácie, robotická chirurgia (vedúci Centra robotickej chirurgie v Banskej Bystrici) a transplantačná medicína (vedúci Transplantačného centra vo FNsP FDR Banská Bystrica). Od roku 2012 poslanec Národnej rady SR a člen Výboru pre zdravotníctvo.